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开云-全球危险病毒数据库上线—新闻—科学网

发布日期:2024-10-26 作者:开云

一个供研究人员同享危险病毒基因组的新数据库,有望解决很多阻碍现有方式的问题。但条件是,必需说服研究人员利用它。

据《天然》报导,这一位为Pathoplexus的数据库在上个月启动,数据库背后的科学家团队但愿有更多研究人员分享已知和新呈现的对公共卫生具有主要意义的基因序列。

Australia悉尼年夜学病毒学家Edward Holmes说,尽量快地同享序列对辨认新病毒、跟踪其变异相当主要,同时也有助在疫苗设计。

Pathoplexus数据库今朝聚焦其他数据库未包括的4种病毒:克里米亚-刚果出血热病毒、苏丹埃博拉病毒、扎伊尔埃博拉病毒和西尼罗河病毒。该团队暗示,稍后还会在数据库中添加其他病原体。

现有最年夜的数据库之一是美国的GenBank,它答应无穷制拜候。可是无穷制拜候意味着理论上任何人都可使用这些数据颁发科学论文,而无需认可数据所有者。这阻碍了科学家,特殊是来自低收入国度的科学家在突发公共卫闹事件时代快速分享他们的数据。

另外一个数据库GISAID要求用户注册,赞成认可数据所有者并极力与所有者合作,旨在确保数据提交者的权力。GISAID一度很是受接待,但研究人员对其治理透明度、若何调整关在诚信的争议等提出了耽忧。

日本东京年夜学进化病毒学家Spyros Lytras说:“在曩昔几年里,GISAID碰到了良多挫折。”但科学界也吸收了教训。“从零最先是我们所需要的,Pathoplexus数据库多是解决方案。”

Pathoplexus数据库为用户供给了一些庇护。例如,研究人员可以对他人若何利用他们的数据进行限制,例如,不答应在没有明白许可的环境下,在一年内将他们的数据作为科学出书物开云体育app的重点。这应当为数据所有者留足了时候来提交他们的研究功效初稿。

用户还必需在他们的出书物中注明数据所有者。“我们的方针是成立一个社区,让研究人员确信他们的进献将获得尊敬和恰当承认。”Pathoplexus数据库团队成员、全球基因组风行病学公共卫生同盟运营负责人Jamie Southgate说。

Pathoplexus不会禁止背反利用条目的小我拜候该网站,而GISAID在少少数环境下会如许做。相反,假如发布的数据背反了条目,该团队将联系期刊,确保数据依照同享体例利用。Pathoplexus数据库的结合开创人、瑞士热带和公共卫生研究所份子风行病学家Emma Hodcroft说:“我们极力让条目十分明白。”

孟加拉儿童健康研究基金会份子微生物学家Senjuti Saha赞成联系出书商的方式。“这是一个很好的、伶俐的解决方案。”她认为,Pathoplexus数据库的透明度将在科学界中成立信赖。

Saha强调,此刻说Pathoplexus存储库可否解决当前的数据同享问题还为时过早。“但这长短常棒的第一步。”

Pathoplexus的建立者极力改良用户体验,例如尽量简化上传进程。Pathoplexus数据库还会查抄序列数据和相干信息的毛病,并帮忙将病毒组织成亚型。

今朝,已稀有千人拜候了该数据库,有50人建立了账户提交数据,但没有人提交序列。为了扩年夜范围,Pathoplexus数据库团队需要取得持久资金。Hodcroft说,此刻的重要使命是吸引捐助者,“我抱着谨严的但愿”。

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